自來水多以氯氣消毒，當氯氣溶於水中會變成次氯酸或次氯酸根離子，即俗稱有效餘氯，因次氯酸具有極高的氧化能力，如自來水含有效餘氯，它在配水管中停留時可預防細菌（病原菌）滋生，因此有效餘氯在自來水的安全衛生上扮演極重要的角色，本省自來水水質標準之有效餘氯的容許範圍是0.2-15豪克/公升，（自由有效餘氯）為了衛生，自來水含有效餘氯是必要的，唯在操作上仍將儘可能保持在較低的濃度範圍，但有時會使自來水產生消毒水味，自來水公司經長期檢驗有效餘氯含量皆可符合標準。